磁粉離合器工作時，傳動軸、轉子、軸承會轉動，熱量就會隨著工作時間的增加而升高，在負載方面超負荷以及磁粉質量問題或者是磁粉不足導致扭矩不足等也會造成磁粉離合器發熱，一般來說運轉中的磁粉離合器表面溫度在 80 ℃以內，水冷卻式離合器90 ℃以內都是正常發熱，超過這個數值就算是異常發熱了。

磁粉離合器冷卻有自冷、強迫風冷及液冷等方式。自冷又分為只靠表面散熱和既靠表面散熱又在主動端加風扇進行自通風冷卻兩種。液冷分為水冷、油冷兩種，器件的結構不同，自然散熱能力也不相同。磁粉離合器長期不清理或者不采取外部散熱輔助措施僅靠磁粉離合器自身設計在兩端鋁蓋子散熱不是長久之計。

磁粉離合器表面溫度越高，磁粉的消耗速度就會越快，甚至會使產品的性能下降，所以散熱非常關鍵，磁粉離合器需要定期進行外部的清潔工作以及設備拆卸維護以及清理作業，使用的磁粉我們可以選用耐高溫的優質磁粉，采用外接大功率風扇1~2臺或者工業專業水冷式散熱法對磁粉制動器和離合器進行散熱。